ปฏิกิริยาภูมิคุ้มกันในสมองดูเหมือนจะมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของโรคอัลไซเมอร์ ในทางใดทางหนึ่งมันเพิ่มเชื้อเพลิงให้กองไฟและเห็นได้ชัดว่าทำให้เกิดการอักเสบที่ในแง่หนึ่งทำให้ตัวเองติดโรคอัลไซเมอร์มีลักษณะเป็นกระจุกของโปรตีน ซึ่งเป็นเนื้อเยื่อที่มีขนาดใหญ่ในสมองคล้ายกับโมเลกุลบนพื้นผิวของแบคทีเรียบางชนิดหลายล้านปีที่ผ่านมาสิ่งมีชีวิต

จึงได้พัฒนากลไกการป้องกันกับโครงสร้างดังกล่าว กลไกเหล่านี้ถูกกำหนดทางพันธุกรรมและดังนั้นจึงเป็นของระบบภูมิคุ้มกัน พวกเขามักจะส่งผลให้เซลล์เก็บขยะบางดูดซับและย่อยโมเลกุลในสมองเซลล์เข้ามามีบทบาทนี้ อย่างไรก็ตามในการทำเช่นนั้นพวกเขาก่อให้เกิดกระบวนการทำลายล้างที่ดูเหมือนจะรับผิดชอบต่อการพัฒนาของภาวะสมองเสื่อม เมื่อสัมผัสกับAßโมเลกุลของสารประกอบเชิงซ้อนบางชนิดจะทำให้เกิดการอักเสบในเซลล์ พวกเขาคล้ายกับวงล้อที่มีเอนไซม์อยู่ด้านนอก สิ่งเหล่านี้สามารถเปิดใช้งานผู้ส่งสารภูมิคุ้มกันและทำให้เกิดการอักเสบโดยการสั่งเซลล์ภูมิคุ้มกันเพิ่มเติมไปยังเว็บไซต์ของการกระทำ